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序列比对的定义
详细介绍双序列比对、blast 以及多
序列比对的
区别,以及均适用于哪些场...
答:
序列比对是生物信息学以及基因组学与进化的基础之一
,其基本思想是:在生物学中普遍存在的序列决定结构、结构决定功能的规律,通过将核酸序列或者蛋白质序列的一级结构看成由基本字符构成的字符串,通过序列比对我们可以找到相似的序列并由此发现生物序列中的功能、结构和进化信息。全局比对:全局比对是指将参与比对的两条序列...
生物系统建模 名词解释
答:
1,序列比对(Sequence Alignment)
序列比对的基本问题是比较两个或两个以上符号序列的相似性或不相似性.从生物学的初衷来看
,这一问题包含了以下几个意义:从相互重叠的序列片断中重构DNA的完整序列.在各种试验条件下从探测数据(probe data)中决定物理和基因图存贮,遍历和比较数据库中的DNA序列比较两个或多个序列的相似...
序列比对
名词解释
答:
序列比对名词解释如下:为确定两个或多个序列之间的相似性以至于同源性,而将它们按照一定的规律排列
。将两个或多个序列排列在一起,标明其相似之处。序列中可以插入间隔(通常用短横线“-”表示)。对应的相同或相似的符号(在核酸中是A, T(或U), C, G,在蛋白质中是氨基酸残基的单字母表示)排...
序列比对
空位罚分原理
答:
序列比对(Sequence
Alignment)是通过在序列中搜索--系列单个性状或性状模式来比较2个(双序列比对)或更多( 多重序列比对)序列的方法
按比对序列条数分类 双序列比对:两条序列的比对 多序列比对:三条或以上序列的比对 1.相似的序列可能具有相似的功能与结构 2.发现一个基因或蛋白哪些区域容易发...
序列比对的序列比对的
统计检验
答:
序列比对实际上是根据特定数学模型找出序列之间最大匹配残基数
。而序列比对数学模型一般用来描述序列中每一个子字符串之间的匹配情况。通过改变某些参数可以得到不同比对结果,例如空位罚分值大小。此外,序列长度差异和字母表复杂度也会影响比对结果。合理调节参数,会减少空位数目,得到较好的结果,而放宽对...
如何比较两组碱基的差异
答:
1、
序列比对
:序列比对是一种比较两个DNA或RNA序列的方法,可以用于找出两组碱基之间的异同。常用的比对软件包括BLAST、Clustal等。通过比对不同组的碱基序列,可以找到它们之间的同源性,以及具体的差异。这种方法适用于对两个或多个较短的碱基序列进行比较。2、蛋白质编码的基因序列比对:蛋白质编码的基因...
多
序列比对的定义
答:
为了便于描述,我们对多
序列比对
过程给出下面
的定义
。把多序列比对看作一张二维表,表中每一行代表一个序列,每一列代表一个残基的位置。将序列依照下列规则填入表中:(a)一个序列所有残基的相对位置保持不变;(b)将不同序列间相同或相似的残基放入同一列,即尽可能将序列间相同或相似残基上下...
怎样
定义
基因
序列比对
答:
基因的
序列比对
就是基因之间的对比,存在着相似性,同源性和一致性;相似性就看他们的碱基互补配对的程度,而同源性则看中是否由同一个祖先进化而来,一致性则是他所表达的基因产物如氨基酸序列等相同的话就是一致性。
序列比对
答:
序列比对
,这一生物学的核心技术,正是基于生命科学的基本规律:序列决定结构,结构决定功能。我们将DNA和蛋白质的序列视为由字符构成的字符串,通过比对,探寻它们之间的相似性,从而揭示生物进化、功能和结构的深层信息。这一过程可分为双序列比对(Pair alignment)和多序列比对(multiple sequence alignment...
基因组
序列比对
算法介绍(一)
答:
全局比对(Global alignment):
全局比对是指将参与比对的两条序列里面的所有字符进行比对
。全局比对在全局范围内对两条序列进行比对打分,找出最佳比对,主要被用来寻找关系密切的序列。其可以用来鉴别或证明新序列与已知序列家族的同源性,是进行分子进化分析的重要前提。其代表是Needleman-Wunsch算法。图一中,...
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