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基因组的功能注释包括
生物信息学常见的数据格式
有哪些
?
答:
2.GenBank格式:GenBank是NCBI(美国国家生物技术信息中心)开发的一种用于存储核酸序列的标准格式。它与FASTA格式类似,但
包含
了更多的元数据信息,如序列长度、描述等。3.GFF格式:GFF(GeneralFeatureFormat)是一种用于表示
基因组注释
信息的文本文件格式。它由三部分组成:头部行、记录行和尾部行。头部行...
简述生物信息学在
基因组
学中的应用
答:
生物信息学在
基因组
学中的应用,是利用生物信息学的理论和技术,对基因组数据进行深入解析、整理和
注释
,从而帮助科学家更全面地理解基因的结构、
功能
和表达调控。1、基因序列分析 序列比对,生物信息学通过对比不同物种或个体的基因序列,揭示序列间的相似性和差异性,为物种分类、进化研究提供依据。结构...
赵国屏(中国科学院院士、分子生物学家)详细资料大全
答:
主要成就 科研成就 研究方向: 研究微生物代谢调控以及酶的结构功能关系与反应机理,开发相应的微生物和蛋白质工程生物技术。主持若干微生物基因组和
功能基因组
研究,完成对重要致病菌问号钩端螺旋体的全基因组测序和
注释
,鉴定若干关键代谢途径和
基因功能
,为深入研究致病机理提供新的思路。主持...
NCBI中各个标注的含义
答:
1)AC_***:genomic mixed,一些可供选择的
注释的基因组
序列,主要用来标记病毒和原核生物;2)AP_***:protein mixed,AC_标记序列对应的蛋白产物;3)NC_***:genomic mixed,完整的基因组分子序列,标记的类别
包括基因组
、染色体、细胞器、质粒;4)NG_***:genomic mixed,不完整的基因组区域...
基因
邻接是什么意思?
答:
基因邻接信息可以用于
基因组注释
和预测。它对于揭示基因组中的基因结构和功能有很大帮助,在预测隐含的生物学特征方面也有重要意义。由于邻接基因往往在生物学过程中具有相似
的功能
,因此对基因邻接的研究可以进一步指导生物学研究和应用。基因邻接对于研究遗传疾病和基因组演化也有极大的意义。在研究遗传疾病的...
转录组数据分析RNA-seq
答:
统计每个
基因的
读段数,通常表达为FPKM(每千个碱基的片段数每百万映射读数)或TPM(每百万转录本的片段数)等标准化指标,以消除基因长度和测序深度的影响。4.差异表达分析:使用统计模型比较不同条件或组别之间的基因表达水平,确定差异表达基因。5.生物学
功能
解释:对差异表达基因进行富集分析,
包括基因
...
在NCBI上怎么找到一个
基因的
外显子和内含子?
答:
这个ID是非常重要的。在这个页面,我们将看到HNF4基因的结构图,从图中给出的信息可以看出,HNF4基因有10个外显子。蓝色部分是UTR区,显示在5’端有一小段序列和3’端有一大段序列是UTR。3.在HNF-4基因的RefSeq区域,我们将可以看到这个基因的参考序列,有mRNA和
基因组的
。这个区域不一定每个基因都...
深度学习给生物学带来了哪些改变
答:
这
包括基因组的
结构
注释
(包括非编码调控序列,蛋白质结合位点预测和剪接位点)。基因组学的一个重要分支是宏基因组学,也被称为环境,生态基因组学或社区基因组学。NGS技术揭示了未经培育且以前没有得到充分研究的微生物的自然多样性。宏基因组学中有几个生物信息学挑战。一个主要挑战是序列数据
的功能
分析和物种多样性...
如何研究lncrna与mrna的关系?
答:
虽然近年来随着
基因
芯片及第二代高通量测序技术的广泛运用,lncRNA不断被发现,但此类转录本的确切功能还未知。目前市场上的lncRNA芯片通常将lncRNA与mRNA设计在一起,RNASeq数据中也
包含
lncRNA, mRNA序列,因此可以通过分析lncRNA与mRNA表达相关性对lncRNA进行
功能注释
。 \x0d\x0a2.分析流程图\x0d\...
中国科学院国家
基因
研究中心的科研领域
答:
水稻全长cDNA库的构建和序列分析水稻T-DNA插入突变体库插入位点的序列测定和数据库的构建水稻重要生物学功能基因的鉴定建立以第二代测序仪为基础的高通量
功能基因组
研究技术体系 基因组水平上
基因注释
相关软件开发及平台建立 水稻籼稻cDNA数据库构建及其它相关数据库的构建水稻高通量测序数据分析(
包括
籼粳稻...
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