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基因组的功能注释包括
基因组注释
分析主要
包括
哪些内容
答:
基因组注释包括以下方面的内容:(1) 重复序列的预测
。通过比对已知的重复序列数据库,找出序列中包含的重复序列,识别类型并转化为N或者X,统计各种类型重复序列的分布。(2) 编码基因的预测。通过将转录组或EST数据比对到拼接后的基因组序列上,找出编码基因位置,预测编码基因结构。或者通过专业的外显...
什么是
基因注释
?
答:
基因组注释 是利用生物信息学方法和工具,对基因组所有基因的生物学功能进行高通量注释。
基因组注释的研究内容包括基因识别和基因功能注释两个方面
。基因识别的核心是确定全基因组序列中所有基因的确切位置。从基因组序列预测新基因,现阶段主要是3 种方法的结合:(1)分析mRNA 和EST数据以直接得到结果;(...
4️⃣ 核酸序列特征分析(8):重复序列的查找
答:
基因组序列主要构成成分是 基因序列,重复序列和基因间序列 。
基因组注释包括基因组结构注释和基因组功能注释 结构注释的核心是基因识别
,为了提高基因识别效率需要首先寻找并标记去除 重复的和低复杂性的序列。重复序列(repetitive sequence)是在基因组中不同位置出现的相同或对称性序列片段,一般...
怎样检查
基因组注释
结果的可靠性
答:
基因组注释主要包括四个研究方向:重复序列的识别;非编码RNA的预测;基因结构预测和基因功能注释
。我们将分别对这四个领域进行阐述。1:重复序列的识别。重复序列的研究背景和意义:重复序列可分为串联重复序列(Tendam repeat)和散在重复序列(Interpersed repeat)两大类。其中串联重复序列包括有微卫星序列,小卫星序列等等;...
最近十年,遗传学(
包括基因组
学)
有哪些
实质性的突破?
答:
这十年Genomics的主要变化就是定量化和可编辑,这段时间
基因组
学的主要任务有以下三种是对基因组进行
功能
性
的注释
(Functional annotation)、理解表观遗传修饰(Epigenetic modification)在基因组中的作用以及大量的基于高通量测序技术的相关表征技术的出现。这三个部分充分融合生命科学和生物技术,联系紧密,使得...
功能基因组
学的四大研究内容
答:
注释
:是指基于
基因组
序列信息,利用各种组学技术,在系统水平上将基因组序列与
基因功能
(
包括基因
网络)以及表型有机联系起来,最终揭示自然界中生物系统不同水平
的功能
的科学。功能基因组用功能不明的分离基因作为起始点,然后选择具有该同源基因的生物模型。这一生物模型可以是简单的酵母细胞或复杂的线虫甚至...
怎么查找植物
基因组
中
的功能注释
答:
怎么查找植物
基因组
中
的功能注释
基因组注释(Genome annotation) 是利用生物信息学方法和工具,对基因组所有基因的生物学功能进行高通量注释,是当前功能基因组学研究的一个热点。
转录测序中的nr,nt,swissprot,cog,kegg,go分别是什么意思
答:
SwissProt数据库是检查过的、手工
注释
的蛋白数据库,我们将Unigene注释到SwissProt数据库,以得到更加高质量的注释结果。COG (clusters of orthologous groups)主要是原核生物和单细胞真核生物的直系同源物,KOG(clusters of euKaryotic Orthologous Groups)数据库
包含
了7个完整
基因组的
真核生物的直系同源家族...
生物信息学的实际应用
有什么
?
答:
基因组注释基因组注释
是将已知的基因和基因组元件与新的基因组数据进行比对和整合,确定基因的准确位置、边界、外显子和内含子等信息的过程。生物信息学中主要的基因组注释工具
包括
NCBI RefSeq、Ensembl和UCSC Genome Browser等。这些工具可以将基因组数据与各种数据库进行比对和整合,提供全面的基因组注释信息...
基因组注释
的介绍
答:
基因组注释
(Genome annotation) 是利用生物信息学方法和工具,对基因组所有基因的生物学功能进行高通量注释,是当前
功能基因组
学研究的一个热点。
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基因注释包括哪些内容
参考基因组没有注释的原因
基因组注释基本原理
什么叫基因注释
基因注释啥意思
基因组注释的策略主要有2种
什么基因功能注释为DB