一、主要是有可能涉及违反发票管理办法，涉嫌代开发票。但这种情况在实际工作中常见，原则上合同与谁签订就由谁开具发票，至于实际收款人与发票开具方不同，一般需要由这两家单位共同盖章出具一份委托收款函即可。
二、税务部门的要求总结一句话：三流一致。发票流、现金流、物流必须一致。即销售方，开票方，收款方为同一主体；购货方，受票方，付款方为同一主体。如果违反上面的规定，就可以能造成虚开虚抵。
三、开票单位与收款单位不一致,这种情况到还是经常有：
第一种情况属于虚开发票，
第二种情况属于代付货款，
如果第二种情况取得A委托B公司的代付货款通知书或者证明，从法律角度讲还算是合理的。
扩展资料：
虚开增值税专用发票的具体行为方式有以下四种：
1、为他人虚开增值税专用发票，指合法拥有增值税专用发票的单位或者个人，明知他人没有货物购销或者没有提供或接受应税劳务而为其开具增值税专用发票，
或者即使有货物购销或者提供了应税劳务但为其开具数量或者金额不实的增值税专用发票或用于骗取出口退税、抵扣税款的其他发票的行为。
2、为自已虚开增值税专用发票。指合法拥有增值税专用发票的单位和个人，在本身没有货物购销或者没有提供或者接受应税劳务的情况下为自己开具增值税专用发票，或者即使有货物购销或者提供或接受了应税劳务但却为自己开具数量或者金额不实的增值税专用发票的行为。
3、让他人为自己虚开增值税专用发票，指没有货物购销或者没有提供或接受应税劳务的单位或者个人要求合法拥有增值税专用发票的单位或者个人为其开具增值税专用发票，
或者即使有货物购销或者提供或接受了应税劳务但要求他人开具数量或者金额不实的增值税专用发票或者进行了实际经营活动，但让他人为自己代开增值税专用发票的行为。
4、介绍他人虚开增值税专用发票，指在合法拥有增值税专用发票的单位或者个人与要求虚开增值税专用发票的单位或者个人之间沟通联系、牵线搭桥的行为。
参考资料来源：百度百科-虚开增值税发票罪