1、形状不同
大西红柿：外形比较大，果色火红，一般呈微扁圆球形。
小西红柿：外形较小，其果实长椭圆形，果色鲜红，种子少，果肉厚。
2、营养程度不同
大西红柿：含有丰富的维生素、矿物质、碳水化合物、有机酸及少量的蛋白质。
小西红柿：小西红柿除了大西红柿所含的营养成分外，其中维生素含量是大西红柿的1.7倍，还可提供更多的膳食纤维。
3、热量不同
大西红柿：热量略低于圣女果，如果二者都当水果生吃，则大西红柿更有助减肥。
小西红柿：每100克含有大约22大卡的热量，热量较高与大西红柿。
以上内容参考：百度百科-小西红柿、百度百科-大西红柿