列方程解决鸡兔同笼问题解法如下：
方程法1：一元一次方程
(一)解:设兔有x只，则鸡有(35-x)只。
列方程：4X+2(35-x)=94
解方程：4X+2*35-2X=94
2X+70=94
2X=94-70
2X=24
解得： X=12
则鸡有:35 - 12 = 23 只
(二)解:设鸡有x只，则兔有(35-x)只。
列方程：2X+4(35-x)=94
解方程：2X+4*35-4X=94
140-2X=94
2X=140-94
2X=46
解得：X=23
则兔有:35 - 23 = 12(只)
答:兔子有12只，鸡有23只。
(注:在设方程的未知数时，通常选择腿多的动物，这将会使计算较简便)
方程法2：二元一次方程组
解:设鸡有x只，兔有y只。
列方程组：X+Y=35
2X+4Y=94
解得：X=12
Y=23
答:兔子有12只，鸡有23只。
古法解决鸡兔同笼问题：
《孙子算经》的作者为本题提出了两种解法：
术曰：上置三十五头，下置九十四足。半其足，得四十七，以少减多，再命之，上三除下四，上五除下七，下有一除上三，下有二除上五，即得。
又术曰：上置头，下置足，半其足，以头除足，以足除头，即得。
所谓的“上置”，“下置”指的是将数字按照上下两行摆在筹算盘上。在算筹盘第一行摆上数字三十五，第二行摆上数字九十四，将脚数除以二，此时第一行是三十五，第二行是四十七。
用较小的头数减去较多的半脚数，四十减去三十（上三除下四），七减去五（上五除下七）。此时下行是十二，三十五减十二（下一除上三，下二除上五）得二十三。此时第一行剩下的算筹就是鸡的数目，第二行的算筹就是兔的数目。
另一种更简单的描述方法是：在第一行摆好三十五，第二行摆好九十四，将脚数除以2，用头数去减半脚数，用剩下的数（我们现在知道这是兔数）减去头数。这样第一行剩下的是鸡数，第二行剩下兔数。
至于头多于一个的“禽兽问题”，“孙子”给出的解法如下：
术曰：倍足以减首，余半之，即兽；以四乘兽，减足，余半之，即禽。
将脚数乘以两倍（此时禽脚与禽头的系数恰好相同），头数减去两倍脚数，除以二，得到兽的只数（八只），兽的只数乘以四（求出兽的脚数），总脚数减去兽的脚数再除以二，得到禽的只数。
如果对照下面的二元方程就会发现，古法相当于是只在操作方程等号的右半边，并没有详细说明操作的系数代表什么。于是也只有“心开者”才能触之即悟了。