深圳社保停缴三个月就会重新计算参保年限。根据《深圳市社会医疗保险办法（修订稿）》第二十五条规定：在医疗保险年度内累计中断参保超过3个月的，重新计算参保年限。
针对“医疗保险中断后不能补缴”这一规定，深圳市社保局新闻发言人黄险峰解释，养老保险是“部分积累制”，即用现在的钱养将来的老，要求基金长期平衡，所以中断以后又恢复缴费的，其缴费年限可以累计计算。
而医疗保险是“现收现付”制，即用现在的钱看现在的病，要求基金当期平衡。“特别是统筹基金是用来互助共济的，当期参保的当然应该享受待遇，当期没有参保的就不能享受待遇了，否则就会损害全体参保人的利益。”
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深圳市社保局医保处处长沈华亮解释，深圳医保分为综合医保、住院医保、劳务工医保三种类型，其中住院医保、劳务工医保缴费较低，采取门诊统筹的方式看病，并未建立个人账户，也不存在清零。而缴费最高的综合医保设个人账户，但不会清零。
沈华亮说，参保人中断参保后，个人账户的钱不但一分也不会少，而且账户余额除可继续在门诊使用外，还可以转移和继承。
所谓“清零”，其实是指“连续缴费年限”的重新计算，一旦该年限被重新计算，将会影响下一年度的医保待遇。但参保人缴纳医保的“累积缴费年限”和个人账户余额并不受医保中断影响，更不会“清零”。
参考资料来源：人民网-深圳社保局回应“医保断缴3个月清零”系误读
社保停交养老账户影响不大，如果是医疗帐户，停交3个月账户清零，如果发生住院等，没有办法报销，个人是自费。重新参保必须6个月以上才可以恢复报销，额度也是跟交费年限有关，长的报销额度高，短的就少点。
社保停交三个月，对养老保险不会有什么影响，因为养老保险个人部分是累计的，所以不会受影响。但是社保中的医疗保险要特殊对待。医疗保险如果三个月内续上，也没有影响。医疗保险中断三个月以上，参保年限就归零，会影响以后住院大病的报销最高限额。
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社保停缴注意事项：
社保停保无时间限制，对于以后的转移也没有影响。如果要转移，应先由原参保所在地社会保险经办机构(下称社保经办机构)开具参保缴费凭证。
参保人员在新就业地按规定建立基本养老保险关系和缴费后，由用人单位或参保人员向新参保地社保经办机构提出基本养老保险关系转移接续的书面申请，原基本养老保险关系所在地社保经办机构在接到同意接收函后，办理好转移接续的各项手续。
如果因为换工作，缴交住房公积金出现了断档，那么需等在新单位缴交住房公积金满六个月后，才可申请住房公积金贷款。
缴纳社会保险一个月后(次月)，每月要和社保代办公司索要缴费证明，或者在社会保险网站登陆查询，看社会保险是否真正缴纳。
参考资料来源：百度百科-社会保险
参考资料来源：百度百科-社保补缴
参考资料来源：百度百科-深圳市人力资源和社会保障局
社保停交三个月医疗保险不会清零，三个月以后，医疗保险会重新计算缴费年限。
1、在一个医疗保险缴纳年度内，社保停止缴纳3个月，医疗保险的缴纳年限清零，将重新计算。个人账户余额在重新缴纳医保后，将会激活，可以继续使用，也就是说，个人缴纳的医保金额不会清零。
2、医保缴费中断3个月，将重新计算其连续参保年限。医保清零是针对参保人缴费年限的清零而不是个人账户清零，逐月划入个人账户的金额不会清零(不设立个人账户的灵活就业人员医保账户内本来就是零)。
3、因未及时办理停保手续，参保人停缴费后，社保部门会要求其缴纳滞纳金，但不会清零其个人账户资金和缴费年限。
4、因工作变更等原因停止参保的人员，可前往参保所在区地税部门办理停保手续，再参保时续保。
本回答被网友采纳医保断缴影响：断缴次月就不能享受医疗保险待遇，看病只能自费。如果断缴3个月以上，连续缴费时间就会清零，需要重新开始累计。除此以外，购买商业医疗险保险保费会上升。
生育险、工伤保险断缴影响：断缴次月无法享受，即使本月续缴，也是次月才能享受。
同时，如果不是深圳户籍，还会影响买房买车和积分入户。买车摇号需医保连续缴满 2 年，买房需连续缴纳社保 5 年，一旦断缴就要重新计算。
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养老保险是五险的重要组成部分，与退休后养老金有着密切的联系，一般是多缴多得。但很多朋友会因为工作的原因，导致养老保险中断，那么养老保险中断三个月有什么影响呢？一起来看看吧。