区别：朱子学是儒家思想的一部分，只是儒家思想的一个分支，不能囊括儒家思想的全部。
理由：儒家文化的历史有将近2500年，其自身是不断演变和发展的。广义上的儒家思想包括先秦时代原始儒家学说（孔子思想、孟子思想、荀子思想）、汉代董仲舒“公羊经学”、汉代经学（古文经学、今文经学）、魏晋玄学、唐代柳（柳宗元）韩（韩愈）“道学”、宋代程（程颐、程颢）朱（朱熹）理学、宋明陆（陆九渊）王（王阳明）心学、明清之际“经世致用”之学（李贽、王夫之、顾炎武、黄宗羲等）、清代乾嘉“汉学”（考据学）、近现代“新儒家”学说。“朱子学”实质上是以南宋朱熹为代表的理学思想。朱子学只是儒学的一个分支，并不是儒学的全部，它同春秋战国时代原始儒家思想有很多区别。
朱子学同原始儒家的区别如下：①原始儒家学说缺乏哲学思辨性，没有对存与灭、名与实、真与假、认识论以及世界本原的哲学探讨；朱子学因为受到魏晋玄学、柳韩“道学”、佛教、道教思想的影响，加入了这些哲学成分。②原始儒家思想虽然强调道义在利益（欲望）之前，但是不绝对反对人们追求个人利益的实现；朱子学受二程影响，也主张“存天理灭人欲”。③原始儒家主张“克己复礼”，但要求遵守的“周礼”，没有三纲五常等内容；朱子学提倡的纲常伦理是典型的礼教，充斥三纲五常、愚忠愚孝、扼杀人性、迫害妇女的内容，已经远远溢出儒家“礼”的正常要求。④原始儒家思想主要是政治学和伦理学范畴，没有太多的神秘主义色彩；朱子学认为“理”是世界本体表现出了强烈的神秘主义性质。