根据国务院2004发布的决定，对于企业不使用政府投资建设的项目，一律不再实行审批制，而是区别不同情况实行核准制和备案制。其中，政府仅对重大项目和限制类项目从维护社会公共利益角度进行核准，其他项目无论规模大小，均改为备案制。对于企业投资建设实行核准制的项目，仅需向政府提交项目申请报告，不再经过批准项目建议书、可行性研究报告和开工报告的程序。但是，在实务过程中，单纯企业投资的项目并不多见，主管机关的审批程序仍然较为严格。
项目建设审批程序一般可以分为：立项审批、规划审批、施工许可。
（1）立项阶段，投资人需要编制项目可研报告，到环保部门和土地部门办理环保预审和用地预审，之后到发改委办理立项审批。
（2）规划阶段，需要到土地部门办理建设用地规划许可，到规划部门办理工程规划许可。其中还可能包括人防、消防审批。
（3）施工阶段需要办理施工许可。