（1）苗期管理
①选择活力好、色泽一致、淡化时间长的蟹苗。
②蟹苗在纯淡水试验杯中，四处游散迅速，无沉苗、死苗，无“飞机”苗，不购买杂苗、花苗和鸳鸯苗。
③加强苗种培育管理：河蟹大眼幼体放进育苗塘前，应培育丰富的生物饵料，以供幼体捕食。当池塘中生物量明显减少时，及时用酵素钙肥泼洒，保持池塘水质和生物量。在整个育苗过程中，坚持做好“三控一防”，即控料、控草、控水温和防缺氧。杜绝使用高残留和高刺激的药物，防止“水瘪子病”的形成。
（2）底质管理
池塘底质在养殖管理中重要性很大，底好水就好，底好发病少，底好草就旺，所以护理池塘底质至关重要。如果在清塘时用药不当，为追求直观效果，使用高残留和高污染的清塘药，这样会严重破坏底质土壤的物理结构和生物平衡，还会使药残被土壤长久储存，危害养殖河蟹因药残对肝胰脏的影响最大，会使河蟹的肝胰腺功能下降，肝胰腺细胞萎缩甚至死亡。建议：放苗后经常用维生素C全池泼洒，解毒抗应激，提高肝胰腺的免疫能力。另外，定期配合使用活性蒜宝拌料投喂，确保河蟹肝肠胃的健康。
（3）水质管理
池塘养殖过程中水体温跃层对河蟹造成危害，同时也是“水瘪子”增多的诱因。温跃层是随着温度的升高，特别是夏季，表、底水层温度相差较大，上下水体很难自由对流混合，导致水质分层。在水质处理上把它比喻成“聚毒层”，对底栖河蟹的影响非常大。当池塘底部因为死亡藻类、残饵粪便等有机物在土壤微生物的作用下，消耗大量溶解氧时，温跃层的形成就会阻碍水的对流与氧的扩散，加重池底缺氧。同时，温跃层自身无氧发酵，产生藻毒素、细菌毒素和化学毒素以及病原微生物。如果此时一旦下雨或加水，立即就会使水体对流，聚毒层的毒素和病菌会影响河蟹的健康。如果长时间阴雨，发生洪水也会导致水体中毒素物质的增多。因为阴雨天残留毒素挥发慢，危害河蟹时间长；洪水期，地下水位整体提高，滞留在底下和土壤的残留会浸透到池塘中，双重因素的影响就会导致河蟹的慢性肝胰腺疾病，形成“水瘪子”。建议：根据气候的变化调控好水质，选用净水、解毒药物于全池泼洒，傍晚或夜间用增氧药物泼洒。
（4）饲料与投喂管理
养殖户片面地追求饲料蛋白质的含量，而忽视了饲料蛋白的质量，使得河蟹摄食后，难消化、难吸收，给河蟹的肝胰腺带来负担，引起肝胰脏综合征，导致“水瘪子”的产生。所以，合理选配饲料、科学投喂至关重要。建议：在池塘中分2～3次投放螺蛳，栽种多品种水草。选择蛋白含量32%～36%的饲料即可，尽量不要更换蛋白含量和饲料品牌，梅雨季节严防投喂霉变的饲料。投喂量控制在以第二天上午检查无剩料为准，蜕壳期和阴雨天减量投喂；发病高峰期停止投喂。
（5）消杀药物管理
在河蟹养殖过程中，建立一个循环的生态养殖环境，养殖户非常难以做到位，经常顾此失彼，导致虫、青苔和蓝藻的大量暴发。遇到这三种问题时，养殖户一般都选择消杀药物清除，来得快、去得快，效果明显。但是，这样不但破坏了水环境，造成缺氧，还会给河蟹的肝肠胃鳃带来直接的刺激和慢性的毒害。使得河蟹吃料减少，免疫力下降，肝细胞萎缩，最终有可能就形成“水瘪子”。建议：应该从健康养殖角度出发，尽量避免多次使用药物消毒杀菌，提倡“养护”理念，以防为主，合理套养，科学用药。在特殊情况下，可采取局部或分段灭杀，并及时解毒和调水。
（6）病原微生物防控
水瘪子”的发生不是一个特定的病症体，而是由多种因素和多个病原体引发的综合症状。因此，保持好一个健康养殖的水环境，积极防控病原微生物的滋长，降低河蟹的发病率，同时也有利于“水瘪子”的康复。