1、性质不同：股票期权是由交易所设计的标准化合约；权证是非标准化合约，由发行人确定合约要素，除上市公司和证券公司独立创设外，还可以作为可分离债的一部分一起发行。
2、发行主体不同：股票期权没有发行人，每位市场参与者在有足够保证金的前提下都可以是期权的卖方；权证的发行主体主要是上市公司、证券公司或大股东等第三方。
3、持仓类型不同：在股票期权交易中，投资者既可以开仓买入期权，也可以开仓卖出期权；对于权证，投资者只能买入。
4、履约担保不同：期权交易的卖出开仓一方因承担义务需要缴纳保证金（保证金数额随着标的证券市值变动而变动）；权证交易中发行人以其资产或信用担保履行。
5、行权后效果不同：认购期权或认沽期权的行权，仅是资产在不同投资者之间的相互转移，不影响上市公司的实际流通总股本数；对于上市公司创设的权证，当认购权证行权时，其发行公司必须按照认购权证上规定的股份数目增发新的股票份数，也就是说认购权证每被执行一次，该公司的实际流通总股本数都会增加。
1、区别一：性质不同
期权：期权是由交易所设计的标准化合约。
权证：权证是非标准化合约，由发行人确定合约要素，除上市公司和证券公司独立创设外，还可以作为可分离债的一部分一起发行。
2、区别二：发行主体不同
期权：期权没有发行人，每位市场参与者在有足够保证金的前提下都可以是期权的卖方。
权证：权证的发行主体主要是上市公司、证券公司或大股东等第三方。
3、区别三：履约担保不同
期权：期权交易的卖出开仓一方因承担义务需要缴纳保证金、
权证：权证交易中发行人以其资产或信用担保履行。
4、持仓类型不同
期权：期权交易中，投资者既可以开仓买入期权，也可以开仓卖出期权。
权证：权证，投资者只能买入。
参考资料来源：
2、权证是一种股票期权，在港交所叫“涡轮”(warrant)。权证是持有人在规定期间内或特定到期日，有权按约定价格(行权价)向发行人购买或出售标的股票，或以现金结算方式收取结算差价的有价证券。权证可分为认购权证和认沽权证。持有认购权证者，可在规定期间内或特定到期日，向发行人购买标的股票，与流行的可转债有权转换成股票相类似；而持有认沽权证者的权利是能以约定价格卖出标的股票。
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在进行个股期权的交易之前，我国曾经有过与之非常类似的一种交易产品存在着，那便是权证。这种权证首次出现的便是大飞乐的配股权证的推出。之后逐渐的出现了认购权证和认沽权证。之后权证便慢慢的退出市场。
期权与权证都是一种选择权。在支付一定的权利金之后，给予持有者按照合约的内容，在规定的期间或者是特定的到期日，按照约定的价格买卖所标的资产的权利。这是持有者的权利凭证。但是这二者之间还是有着许多的差别之处的：
(1)发行主体不同。期权是没有发行人的，每一个市场参与者在有足够保证金的前提下都可以成为期权的卖方。期权交易属于不同投资者之间的交易。
当投资者买入一个公司的认购期权时，卖出期权的是普通投资者。但是权证就不是这样了，一般来说都是由标的证券上市公司、投资银行或者大股东等这些第三方发行的。交易两方是股票权证的发行人与持有人。
当投资者买入甲公司的权证时，卖出权证的是甲公司或者它所委托的证券公司。如果卖出的机构是甲公司自己，就叫做股本权证;卖出的机构是证券公司，就叫做备兑权证。这些都是我们做个股期权交易首先要学习的股票基础知识内容，这是了解这样一种交易模式的基础。
(2)交易方式不同，期权交易比权证更灵活。投资者能够买入或卖出认购期权，也能够买入或者卖出认沽期权。但是权证的话，对于普通的投资者来说只可以买入权证，只有发行人才能够卖出权证获得权利金。此外投资者也能够在二级市场交易手中已持有的权证。
(3)合约特点不同，期权合约是标准化合约，而权证不是的。期权合约中的行权价格、标的物和到期时间等都是由市场统一规定好的，而权证合约里面的行权价格、标的物、到期时间等都是由发行者决定的。
(4)合约供给量不同。从理论上说期权的供给无极限，只要有交易就能够不断的产生。但是权证的供给有限，由发行人确定，受到发行人的意愿、资金能力以及市场上流通的标的证券数量等因素约束。
(5)履约担保不同。期权的开仓方因承担义务需要缴纳保证金，其随标的证券市值变动而变动。而权证的发行人以其资产或信用担保履行。
(6)行权后效果不同。认购期权或认沽期权的行权，仅是标的证券在不同投资者之间的相互转移，不影响上市公司的实际流通总股本数;对于上市公司发行的股本权证，当投资者对持有的认购权证行权时，发行人必须按照约定的股份数增发新的股票，从而导致公司的实际流通总股本数增加。
（1）有无发行环节。股本权证在进入交易市场之前，必须由发行股票的公司向市场发行。而股票期权无须经过发行环节，只要买卖双方同意，就可以直接成交。
(2）数量是否有限。股本权证由于先发行后交易，在发行后，其流通数量是相对固定的。而股票期权没有发行环节，只要有人愿买，有人愿卖，就可以成交，因此其数量在理论上是无限的。
(3) 是否影响总股本。股本权证行权后.公司总股本的增减等于行使股本权证时所买卖的股票数量,从而对股票价格有压低或提升的作用;股票期权行权时所需股票完全从市场上购人上市公司的总股本并不会增减,期权行权对上市公司无任何影响。
备兑权证比股本权证更贴近于股票期权，因为备兑权证的行权也不会影响公司的总股本。因此，两者的区别仅在于有无发行环节和数量是否有限。